Вода – химически очень активное соединение, представляющее собой смесь многих солей, металлов, оксидов, различных химических групп. Чистая вода ничем не пахнет. Проходя через слои грунта, она насыщается солями. Кроме того вода щедро населена бактериями, вирусами, простейшими и другими гидробионтами. Все эти примеси меняют её свойства: запах, вкус, цвет. Поэтому, почувствовав запах воды из скважины, можно судить о её качестве и химическом составе.

Вещества, которые меняют запах воды, называются одорантами. Одоранты появляются в воде если она она вступает в реакции с химическими соединениями(растворение в воде железа, сероводорода, аммиака и др.), а также в результате жизнедеятельности микроорганизмов и растений. Бактерии и водоросли на протяжении всей своей жизни выделяют сильно пахнущие вещества: меркаптаны, 2-метилизоборнеол (МИБ), геосмин, бета-циклоцитраль, диметилдисульфид, 2,4-гептадиенал, 2,6-нонадиенал.

К запахам естественного происхождения относят: землистый, рыбный, гнилостный, болотный, железистый и т.д., а к искусственным: хлорный, фенольный, аптечный, запах нефтепродуктов и т.д.

Для подземных вод, добываемых из скважин при помощи насосов, основными причинами запаха являются сероводород, железо, аммиак, марганец в зависимости от состава почвы.

Сероводород появляется в воде в результате разложения органических веществ и жизнедеятельности анаэробных бактерий. Данное соединение токсично, поэтому такую воду надо очищать. Если вода из скважины пахнет тухлыми яйцами, вызывая отвращения, то это свидетельствует о наличии в ней большого количества сероводорода. Похожий запах вызывает повышенное содержание марганца (более 25 мг/л). При концентрация марганца от 0,1 до 25 мг/л вода не имеет специфического запаха, но при насыщении кислородом воздуха приобретает черный оттенок – марганец окисляется и выпадает в осадок.

Часто вода из скважины пахнет железом - самым распространенным загрязнителем, который при реагировании с кислородом воздуха переходит в трехвалентную форму. Поэтому вода, только что добытая из скважины выглядит чистой и только потом приобретает бурый цвет и неприятный металлический, железистый запах.

Аммиак намного реже встречается в воде, добываемой из скважин. Это газ без цвета с резким запахом, похожем на запах нашатырного спирта.

Для каждого из этих веществ существуют показатели предельного содержания в воде, ниже которого они не являются опасными для здоровья. Их значения можно найти в нормативной литературе. А чтобы очистить подземную воду до необходимого содержания одонаторов применяются реагентные и безреагентные методы очистки. Они основаны на окислительно-восстановительных реакциях металлов с веществами: озон, кислород, хлор. Методами очистки являются: фильтрование, аэрация, коагуляция, флотация.